產品簡介

為解決作物在雜交育種中的早期材料選育效率低，以及現有基因組預測模型泛化能力低的問題，智數生物在海南省種業實驗室揭榜掛帥項目的支持下，基于農業大數據，開發了智能育種決策輔助系統（BGI智能育種系統）。在系統使用方面，智數生物已將該系統部署在崖州灣科技城先進計算中心上，育種家可通過訪問網站（http://59.50.39.12:8090/），創建育種項目，上傳相關基因型-表型數據，在網頁上實現表型預測、育種材料篩選。BGI智能育種系統由4個分析平臺，1個種質資源數據庫組成。

其中，以全基因組選擇平臺為核心，對目標表型進行預測；以育種表型數據管理平臺、基因型數據分析平臺為輔助，對育種材料進行統計分析、群體遺傳結構分析等工作；以雜交模擬平臺為特色，對雜交群體的親本組配方式進行優選；以種質資源數據庫為基礎，對系統內置的基因組預測模型進行前期訓練工作。

全基因組選擇平臺內置了10個經典模型，以及1個基因組預測AI模型，并將該模型命名為DeepGxE。同時，該模型也是本平臺的第一個創新點。該模型建立基于環境型和基因型數據，且使用GPU加速計算過程。在多個作物上對該模型進行基準測試，結果表明，與經典的基因組預測模型比較，該模型運行速度更快、預測性能更高、泛化性能更高。此外，該模型可用于兩類環境型數據：一類是簡易的數據，取時間、地點作為環境型數據，適用于多年多點；另一類是詳細的氣候數據、地理位置數據，如每天的溫度、濕度等。本平臺的第二個創新點是集成了現有經典的基因組預測模型，可供育種家靈活選擇，自主訓練。

產品服務

智數生物結合南繁育種基地的技術優勢、材料優勢、測試點優勢，利用自主建設的一流測序平臺，以及優秀的生物信息技術團隊、人工智能團隊，建立結合“AI預測+育種經驗”的智能育種決策輔助系統，為育種家提供優質的智能育種服務。我們愿與相關育種企業合作，開展大數據智能育種的合作，充分發揮BGI智能育種系統的優勢，建立育種賬號，開展全基因組選擇育種的合作，并可提供育種材料的測序服務、基因分型服務（如液相芯片捕獲試劑盒開發、多重PCR試劑盒開發、少量位點的基因分型等）、個性化生物信息分析（如全基因組關聯分析、轉錄組分析等），高通量基因編輯服務，力爭在3到5年內共同打造優質新品種，完成產業轉化，實現收益共享。