a. 工具簡介

ImageStudio是時空組學線下圖像處理軟件，主要涉及圖像質量評估和圖像手動調整模塊（圖像拼接、組織分割和細胞分割）。圖像質量評估主要從圖像清晰度和圖像track線兩個評估指標對顯微鏡拍攝的圖像進行評分，用于判斷是否滿足下游的數據分析。圖像的手動調整模塊，主要針對自動的拼接或者分割算法無法滿足的場景，借助手動工具對圖像進行處理。

b. 功能介紹

1. 圖像質控

圖像質控模塊主要評估時空組學項目中顯微鏡的圖像質量是否滿足后續數據分析的需求。圖像質控模塊主要包含："ssDNA/DAPI"和 DAPI&mIF 圖像QC、TIFF/PNG格式的圖片上傳及配置數據上傳方式三大功能。

2. 圖像拼接

圖像拼接模塊基于芯片自身Track線，用于手動調整顯微鏡小圖的拼接效果，輸入文件應為圖像QC結果為PASS的顯微鏡小圖文件。

3. 圖像校準

圖像校準模塊用于手動調整 mIF 中蛋白與 DAPI 的校準，主要從水平和垂直方向。輸入文件為 DAPI&mIF 圖像 QC 后的數據。

4. 組織分割

組織分割模塊用于手動調整分割后的組織mask。